Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETMD1Q6P1Q0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms