Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXNQ16595 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FXNQ16595 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FXNQ16595 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FXNQ16595 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FXNQ16595 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FXNQ16595 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FXNQ16595 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FXNQ16595 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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FXNQ16595 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FXNQ16595 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FXNQ16595 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXNQ16595 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXNQ16595 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXNQ16595 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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