Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NID2Q14112 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NID2Q14112 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NID2Q14112 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NID2Q14112 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NID2Q14112 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NID2Q14112 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NID2Q14112 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NID2Q14112 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NID2Q14112 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NID2Q14112 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NID2Q14112 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NID2Q14112 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NID2Q14112 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NID2Q14112 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NID2Q14112 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NID2Q14112 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NID2Q14112 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NID2Q14112 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NID2Q14112 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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