Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YJR026WYJR026W 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YJR028WYJR028W 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YAR010CYAR010C 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YML040WYML040W 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YMR051CYMR051C 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 CUS1YMR240C 1311 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 ASA1YPR085C 1332 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 CAB3YKL088W 1716 nt4.92□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YPK3YBR028C 1578 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 DAK1YML070W 1755 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 SYG1YIL047C 2709 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 GLT1YDL171C 6438 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 DUO1YGL061C 744 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YMR082CYMR082C 357 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 GSP2YOR185C 663 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 PRR2YDL214C 2100 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 ATE1YGL017W 1512 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 YOR1YGR281W 4434 nt4.91□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 GRS1YBR121C 2004 nt4.9□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 PWP1YLR196W 1731 nt4.9□□□□□ -1.62
NMD4Q12129 COS7YDL248W 1152 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 PHO92YDR374C 921 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 COS5YJR161C 1152 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 TPP1YMR156C 717 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 NDJ1YOL104C 1059 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 MDY2YOL111C 639 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ISU2YOR226C 471 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 APJ1YNL077W 1587 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 TUP1YCR084C 2142 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ADY3YDL239C 2373 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 PUS1YPL212C 1635 nt4.9□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 DOS2YDR068W 933 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CAB1YDR531W 1104 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 MRF1YGL143C 1242 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 TIS11YLR136C 858 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CUS2YNL286W 858 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 BSD2YBR290W 966 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 HPC2YBR215W 1878 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CTS1YLR286C 1689 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 PHO90YJL198W 2646 nt4.89□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 EXO1YOR033C 2109 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 BIT2YBR270C 1638 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CNL1YDR357C 369 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CTR3YLR411W 726 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 YOL024WYOL024W 519 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CAM1YPL048W 1248 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ACS2YLR153C 2052 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ZUO1YGR285C 1302 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 RNY1YPL123C 1305 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ARN1YHL040C 1884 nt4.88□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ARO9YHR137W 1542 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 VID30YGL227W 2877 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 MDL1YLR188W 2088 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 YGR015CYGR015C 987 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 MRI1YPR118W 1236 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ATG14YBR128C 1035 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 YCL041CYCL041C 495 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 HES1YOR237W 1305 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 PHO12YHR215W 1404 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 PHO11YAR071W 1404 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ADE13YLR359W 1449 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 SLT2YHR030C 1455 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ALD3YMR169C 1521 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ALD2YMR170C 1521 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ECM32YER176W 3366 nt4.87□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 NTH2YBR001C 2343 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 GDB1YPR184W 4611 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 IWR1YDL115C 1062 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 YLR225CYLR225C 1224 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 SCW10YMR305C 1170 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 VHS2YIL135C 1311 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 KTR7YIL085C 1554 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 MCX1YBR227C 1563 nt4.86□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 NDC1YML031W 1968 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 CYK3YDL117W 2658 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 YDR282CYDR282C 1245 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 SPL2YHR136C 447 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 SNL1YIL016W 480 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 NIT2YJL126W 924 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 EMG1YLR186W 759 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ELA1YNL230C 1140 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 BBP1YPL255W 1158 nt4.85□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 PRR1YKL116C 1557 nt4.84□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 THP1YOL072W 1368 nt4.84□□□□□ -1.63
NMD4Q12129 ABD1YBR236C 1311 nt4.84□□□□□ -1.63
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