Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YNL050CYNL050C 813 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 TRM10YOL093W 882 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 CIN2YPL241C 807 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RBD2YPL246C 789 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 IVY1YDR229W 1362 nt6.14□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF3Q07807 PAT1YCR077C 2391 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ERC1YHR032W 1746 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RVS161YCR009C 798 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YCR108CYCR108C 192 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 LSM4YER112W 564 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 DSD1YGL196W 1287 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YGR015CYGR015C 987 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 HUA2YOR284W 732 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ARO4YBR249C 1113 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 HOS1YPR068C 1413 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 SHM1YBR263W 1473 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 TGL1YKL140W 1647 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ATP16YDL004W 483 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RPB7YDR404C 516 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 CAB1YDR531W 1104 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 SPO74YGL170C 1242 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 NOP7YGR103W 1818 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 NPA3YJR072C 1158 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YJR157WYJR157W 363 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 NSE1YLR007W 1011 nt6.12□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF3Q07807 MIC27YNL100W 705 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 UBC11YOR339C 471 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 UMP1YBR173C 447 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 APE3YBR286W 1614 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RRP7YCL031C 894 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 BNA5YLR231C 1362 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 HMS1YOR032C 1305 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 CRD1YDL142C 852 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 DET1YDR051C 1005 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 PLP1YDR183W 693 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 DAM1YGR113W 1032 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 BAT2YJR148W 1131 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 SIC1YLR079W 855 nt6.11□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF3Q07807 NIT3YLR351C 876 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 MAC1YMR021C 1254 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 HEK2YBL032W 1146 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 TOM7YNL070W 183 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 GAL7YBR018C 1101 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YPL261CYPL261C 309 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RSA4YCR072C 1548 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 CLB2YPR119W 1476 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YDR109CYDR109C 2148 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ACS1YAL054C 2142 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 snR83snR83 306 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 PCT1YGR202C 1275 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 BGL2YGR282C 942 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 PPX1YHR201C 1194 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 PER33YLR064W 822 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 DUG3YNL191W 1074 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YOL118CYOL118C 309 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RAD7YJR052W 1698 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 BI3Q0115 1554 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 COM2YER130C 1332 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ASN1YPR145W 1719 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RML2YEL050C 1182 nt6.09□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF3Q07807 YIL082WYIL082W 873 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 AIM19YIL087C 474 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 TEF4YKL081W 1239 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 HOT13YKL084W 351 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 REC102YLR329W 795 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 SAS2YMR127C 1017 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RPC19YNL113W 429 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YBR071WYBR071W 636 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RPO26YPR187W 468 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ESC8YOL017W 2145 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 PRD1YCL057W 2139 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YNL011CYNL011C 1335 nt6.08□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 SPR28YDR218C 1272 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 MOB2YFL034C-B 864 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CKA1YIL035C 1119 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YIL089WYIL089W 618 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 RFA3YJL173C 369 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 STM1YLR150W 822 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YLR334CYLR334C 381 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ECM13YBL043W 774 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 MDY2YOL111C 639 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 NPT1YOR209C 1290 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 FIG1YBR040W 897 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YPR012WYPR012W 255 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 MRS2YOR334W 1413 nt6.08□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 YDR387CYDR387C 1668 nt6.07□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 RMD9YGL107C 1941 nt6.07□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CPR4YCR069W 957 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 EFG1YGR271C-A 702 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 DOG2YHR043C 741 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 DOG1YHR044C 741 nt6.07□□□□□ -1.44
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