Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP2P46087 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP2P46087 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP2P46087 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP2P46087 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP2P46087 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP2P46087 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP2P46087 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP2P46087 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP2P46087 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP2P46087 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP2P46087 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP2P46087 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP2P46087 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP2P46087 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP2P46087 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP2P46087 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP2P46087 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP2P46087 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP2P46087 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP2P46087 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP2P46087 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP2P46087 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP2P46087 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP2P46087 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms