Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 snR3snR3 194 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YCL012CYCL012C 405 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 GCR2YNL199C 1605 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 DUG1YFR044C 1446 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 MLF3YNL074C 1359 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 GIP1YBR045C 1920 nt5.29□□□□□ -1.56
VFA1P40080 IRC6YFR043C 714 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 PAU17YLL025W 375 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 ATP14YLR295C 375 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 CUE5YOR042W 1236 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 CAM1YPL048W 1248 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 YCL041CYCL041C 495 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 OCA5YHL029C 2040 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 GAS2YLR343W 1668 nt5.28□□□□□ -1.56
VFA1P40080 CUS1YMR240C 1311 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 ASA1YPR085C 1332 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YMR102CYMR102C 2505 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YDR396WYDR396W 501 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YEL067CYEL067C 588 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 DAL3YIR032C 588 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 MTC1YJL123C 1437 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YKR104WYKR104W 921 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YLR036CYLR036C 612 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PCL1YNL289W 840 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 SOL1YNR034W 966 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 TOM5YPR133W-A 153 nt5.27□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CDC4YFL009W 2340 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 UBP7YIL156W 3216 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YDR336WYDR336W 945 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YFL064CYFL064C 525 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PUS6YGR169C 1215 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YKL107WYKL107W 930 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 MRP51YPL118W 1035 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YPR202WYPR202W 717 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 RIM15YFL033C 5313 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 MPP10YJR002W 1782 nt5.26□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CLA4YNL298W 2529 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 TRP4YDR354W 1143 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YGR153WYGR153W 654 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 OKP1YGR179C 1221 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CIR1YGR207C 786 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PRE7YBL041W 726 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 TRM10YOL093W 882 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 BAG7YOR134W 1230 nt5.25□□□□□ -1.57
VFA1P40080 EMP46YLR080W 1335 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 ADE13YLR359W 1449 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CBP1YJL209W 1965 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PHO90YJL198W 2646 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 RPS16BYDL083C 432 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PDE1YGL248W 1110 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CIA2YHR122W 696 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 WSS1YHR134W 810 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YIL028WYIL028W 399 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YKR047WYKR047W 306 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 SPO20YMR017W 1194 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 NOP2YNL061W 1857 nt5.24□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PCS60YBR222C 1632 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 IFM1YOL023W 2031 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CCZ1YBR131W 2115 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 AIR2YDL175C 1035 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YKL023WYKL023W 834 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 MRPS8YMR158W 468 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 CTL1YMR180C 963 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YNL174WYNL174W 573 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 SPS18YNL204C 903 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 IMD3YLR432W 1572 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 TPS3YMR261C 3165 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 MET3YJR010W 1536 nt5.23□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PRR2YDL214C 2100 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 PRM10YJL108C 1152 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 RPS0BYLR048W 759 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YLR374CYLR374C 390 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 YPL062WYPL062W 405 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 AXL2YIL140W 2472 nt5.22□□□□□ -1.57
VFA1P40080 RAD7YJR052W 1698 nt5.21□□□□□ -1.57
VFA1P40080 TIP20YGL145W 2106 nt5.21□□□□□ -1.57
VFA1P40080 STE20YHL007C 2820 nt5.21□□□□□ -1.57
VFA1P40080 SKG3YLR187W 3081 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 RAD57YDR004W 1383 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 MRPL7YDR237W 879 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 YIL152WYIL152W 708 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 TFA2YKR062W 987 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 ERG3YLR056W 1098 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 HRT3YLR097C 1035 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 MIM2YLR099W-A 264 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 PSY3YLR376C 729 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 MDY2YOL111C 639 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 MNT2YGL257C 1677 nt5.21□□□□□ -1.58
VFA1P40080 YFT2YDR319C 825 nt5.2□□□□□ -1.58
VFA1P40080 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.2□□□□□ -1.58
VFA1P40080 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.2□□□□□ -1.58
VFA1P40080 SFK1YKL051W 1062 nt5.2□□□□□ -1.58
VFA1P40080 EMG1YLR186W 759 nt5.2□□□□□ -1.58
VFA1P40080 YBL077WYBL077W 432 nt5.2□□□□□ -1.58
VFA1P40080 SIS2YKR072C 1689 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.7 ms