Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA4P22748 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA4P22748 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA4P22748 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA4P22748 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA4P22748 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA4P22748 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA4P22748 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA4P22748 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA4P22748 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA4P22748 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA4P22748 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA4P22748 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA4P22748 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA4P22748 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA4P22748 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA4P22748 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA4P22748 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA4P22748 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA4P22748 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA4P22748 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms