Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFD2P13995 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms