Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms