Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL6Q9UKU0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL6Q9UKU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms