Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJC17Q9NVM6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms