Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASS4Q9NQ75 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms