Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZCCHC17Q9NP64 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZCCHC17Q9NP64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms