Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC34Q96HJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC34Q96HJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.5 ms