Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK2Q16620 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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