Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP2C1P98194 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms