Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTD2P86397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTD2P86397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HTD2P86397 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HTD2P86397 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTD2P86397 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTD2P86397 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTD2P86397 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTD2P86397 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTD2P86397 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTD2P86397 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTD2P86397 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms