Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCP4P48539 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCP4P48539 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCP4P48539 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCP4P48539 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCP4P48539 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms