Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5LO95447 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms