Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC2O95347 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC2O95347 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC2O95347 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC2O95347 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC2O95347 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC2O95347 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC2O95347 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC2O95347 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC2O95347 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC2O95347 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC2O95347 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC2O95347 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC2O95347 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC2O95347 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC2O95347 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC2O95347 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC2O95347 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC2O95347 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC2O95347 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC2O95347 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC2O95347 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC2O95347 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC2O95347 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC2O95347 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC2O95347 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC2O95347 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC2O95347 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC2O95347 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC2O95347 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms