Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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