Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX2Q9NPC8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX2Q9NPC8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIX2Q9NPC8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX2Q9NPC8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms