Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms