Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX31Q8N9S9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX31Q8N9S9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX31Q8N9S9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms