Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUL8

CILP2, Cartilage intermediate layer protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILP2Q8IUL8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILP2Q8IUL8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CILP2Q8IUL8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CILP2Q8IUL8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms