Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
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