Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms