Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NF2P35240 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NF2P35240 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NF2P35240 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NF2P35240 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NF2P35240 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NF2P35240 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NF2P35240 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NF2P35240 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NF2P35240 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NF2P35240 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NF2P35240 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NF2P35240 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NF2P35240 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NF2P35240 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NF2P35240 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NF2P35240 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NF2P35240 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NF2P35240 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NF2P35240 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NF2P35240 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NF2P35240 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NF2P35240 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NF2P35240 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NF2P35240 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NF2P35240 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NF2P35240 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NF2P35240 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms