Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms