Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8BQ9ULN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8BQ9ULN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8BQ9ULN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms