Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11EQ9UL52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11EQ9UL52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms