Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA1Q9UIW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA1Q9UIW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms