Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGGBP1Q9UFW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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