Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3AQ9NVI7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3AQ9NVI7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms