Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM56Q9BRZ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM56Q9BRZ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms