Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOQ99835 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOQ99835 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOQ99835 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOQ99835 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMOQ99835 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMOQ99835 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMOQ99835 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMOQ99835 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMOQ99835 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOQ99835 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOQ99835 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOQ99835 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOQ99835 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOQ99835 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOQ99835 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOQ99835 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOQ99835 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOQ99835 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMOQ99835 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMOQ99835 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOQ99835 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOQ99835 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms