Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOX2Q96NM4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOX2Q96NM4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOX2Q96NM4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms