Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGDCC3Q8IVU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGDCC3Q8IVU1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGDCC3Q8IVU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms