Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREML4Q6UXN2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREML4Q6UXN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms