Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.2 ms