Protein–RNA interactions for Protein: P39734

FRT2, Protein HPH2, yeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FRT2	P39734	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.95	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	TLG2	YOL018C	1194 nt		4.95	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	YNL247W	YNL247W	2304 nt		4.95	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	BUD22	YMR014W	1560 nt		4.95	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	APJ1	YNL077W	1587 nt		4.95	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	AIM17	YHL021C	1398 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	NOB1	YOR056C	1380 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	THI5	YFL058W	1023 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	ERG3	YLR056W	1098 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	REC114	YMR133W	1287 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	THI12	YNL332W	1023 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	ECM7	YLR443W	1347 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.94	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	NDC1	YML031W	1968 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	SEH1	YGL100W	1050 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	GON7	YJL184W	372 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	MRP21	YBL090W	534 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	YCL041C	YCL041C	495 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	ASA1	YPR085C	1332 nt		4.93	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.92	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.92	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	MSS116	YDR194C	1995 nt		4.92	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	CRT10	YOL063C	2874 nt		4.92	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.92	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.92	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	YEL009C-A	YEL009C-A	408 nt		4.91	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.91	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	APL6	YGR261C	2430 nt		4.91	□□□□□ -1.62
FRT2	P39734	LDB18	YLL049W	540 nt		4.9	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	PNP1	YLR209C	936 nt		4.9	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	ATG17	YLR423C	1254 nt		4.9	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		4.9	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.9	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	SCM3	YDL139C	672 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	PRM10	YJL108C	1152 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YKL023W	YKL023W	834 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	MAP2	YBL091C	1266 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	TRS33	YOR115C	807 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.89	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	SRG1	SRG1	551 nt		4.88	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	SSO1	YPL232W	873 nt		4.88	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	VHS2	YIL135C	1311 nt		4.88	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	THI21	YPL258C	1656 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YER084W	YER084W	387 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	BNS1	YGR230W	414 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.87	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	PDR10	YOR328W	4695 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	FAP1	YNL023C	2898 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	RMR1	YGL250W	726 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	NSG1	YHR133C	876 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	SEC13	YLR208W	894 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YLR283W	YLR283W	945 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YJR124C	YJR124C	1347 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	MTC1	YJL123C	1437 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.86	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	GAT4	YIR013C	366 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	ATP14	YLR295C	375 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	GRE1	YPL223C	507 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	DBF2	YGR092W	1719 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	HPC2	YBR215W	1878 nt		4.85	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	YPL245W	YPL245W	1365 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	NPT1	YOR209C	1290 nt		4.84	□□□□□ -1.63
FRT2	P39734	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.84	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	HOF1	YMR032W	2010 nt		4.84	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	GAL4	YPL248C	2646 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	UGA2	YBR006W	1494 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	FUM1	YPL262W	1467 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	LCP5	YER127W	1074 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	TRM10	YOL093W	882 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	NHP6A	YPR052C	282 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	MBP1	YDL056W	2502 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	HXT4	YHR092C	1731 nt		4.83	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	MMT2	YPL224C	1455 nt		4.82	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	IPK1	YDR315C	846 nt		4.82	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.82	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	COG5	YNL051W	1212 nt		4.82	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.82	□□□□□ -1.64
FRT2	P39734	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms