Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZKSCAN1P17029 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN1P17029 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms