Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC2P02585 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.2 ms