Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC2O95347 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC2O95347 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC2O95347 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC2O95347 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC2O95347 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC2O95347 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC2O95347 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC2O95347 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC2O95347 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC2O95347 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC2O95347 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC2O95347 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC2O95347 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC2O95347 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMC2O95347 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC2O95347 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC2O95347 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC2O95347 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC2O95347 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC2O95347 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC2O95347 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC2O95347 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC2O95347 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC2O95347 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC2O95347 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC2O95347 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC2O95347 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC2O95347 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC2O95347 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC2O95347 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC2O95347 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC2O95347 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC2O95347 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms