Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX16O60231 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX16O60231 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX16O60231 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX16O60231 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX16O60231 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX16O60231 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX16O60231 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX16O60231 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX16O60231 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX16O60231 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX16O60231 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX16O60231 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX16O60231 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX16O60231 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX16O60231 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX16O60231 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX16O60231 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX16O60231 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX16O60231 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX16O60231 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX16O60231 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX16O60231 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX16O60231 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX16O60231 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX16O60231 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX16O60231 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX16O60231 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX16O60231 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX16O60231 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX16O60231 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX16O60231 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms