Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01553A4QN01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01553A4QN01 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms