Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL1Q9UKG1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
APPL1Q9UKG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms