Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF3Q12996 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTF3Q12996 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTF3Q12996 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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