Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00205P59089 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms